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Les Règnes de la Vie
Le paradigme des cinq règnes
Le paradigme des trois domaines
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Jusqu'aux années 1950 et 1960, les manuels ne faisaient référence qu'à deux règnes d'êtres vivants, le règne animal (incluant les protozoaires) et le règne végétal (incluant les bactéries). Cette division avait déjà été suggérée par Linné, puis retenue par des systèmes de pensée ésotériques comme la Théosophie et l'Anthroposophie, ainsi que des paradigmes s'étendant tant à la science qu'à la métaphysique, tels que ceux d'Arthur Young et Edward Haskell. Chez tous, des règnes inanimés (le règne minéral, et, dans le cas de la Théosophie des règnes non physiques ou élémentaux) s'y ajoutaient, sur un pied d'égalité avec les plantes et les animaux.
Il est vrai qu'au niveau macroscopique, faire la différence entre une plante et un animal n'est pas particulièrement difficile. Une plante reste fixée à un endroit déterminé et fabrique du glucose à partir de lumière solaire, de dioxyde de carbone et d'eau, tandis qu'un animal se déplace et doit trouver sa nourriture hors de lui-même. Mais cet état de fait disparaît au niveau microscopique. Certains organismes unicellulaires ont la capacité d'agir alternativement comme des plantes ou comme des animaux. Euglena, par example, produit sa nourriture par photosynthèse avec l'aide de la lumière du soleil, mais peut aussi consommer de la matière organique comme un animal. Citons aussi le cas des bactéries et des algues bleues-vertes, dont les différences structurelles avec les organismes plus évolués sont infiniment plus grandes que celles séparant les plantes des animaux. Un changement de paradigme était nécessaire. L'aboutissement en a été l'hypothèse des cinq règnes.
Les progrès de la connaissance scientifique se sont accompagnés d'une divergence croissante de la science et de la métaphysique, jusqu'à ce qu'en 1959 R. H. Whittaker ne remplace la dichotomie peu maniable entre règne végétal et règne animal par une division en cinq règnes : animaux, plantes, Fungi, protistes ou protoctistes, et monères (bactéries et algues bleues et vertes, avec une structure cellulaire prokaryote très simple). Ce système a été perfectionné par Lynn Margulis. Particulièrement pratique, il est encore utilisé aujourd'hui dans de nombreux manuels. Mais il s'est toutefois récemment révélé inadéquat, face à l'impressionnante diversité métabolique des Monera et des Protista, et au fait que ces deux taxa sont paraphylétiques, et donc inutilisables dans le système cladistique moderne. D'où le modèle dit des trois domaines, actuellement en vogue.
Les recherches en génétique de la dernière décennie ont révélé que les bactéries anaérobiques, trouvée dans des environnements hostiles et privés d'oxygène, sont génétiquement et métaboliquement complètement différentes des autres organismes, qui respirent l'oxygène. Ces bactéries, appelées Archaeobacteria, ou simplement Archaea, sont considérées comme des « fossiles vivants » apparus alors que l'atmosphère de la Terre n'était pas encore un réservoir d'oxygène, c'est-à-dire aux tous premiers âges de la planète. Des analyses d'ADN et d'ARN ont suggéré à certains chercheurs l'existence de trois domaines, plutôt que de cinq règnes : Archaea, Bacteria, et Eukarya (Eukaryota). Ce dernier groupe contient les organismes dont le matériel génétique est isolé par une membrane spéciale, le noyau, c'est-à-dire tous les organismes supérieurs, des protistes aux humains. Eukarya semble contenir non pas quatre règnes, mais une bonne dizaine, à tel point que le terme de règne est, dans cette acception, tombé en désuétude. La diversité de la vie apparaît donc bien plus complexe que ce que l'on imaginait, les organismes qui nous sont familiers, plantes et animaux, ne représentent qu'une toute petite partie des formes de vie.
| Deux Règnes | Cinq Règnes | Trois domaines et and beaucoups de « règnes » | |
| Animalia (touts les Metazoa) | Animalia | Eukarya | Animalia |
| Plantae | Fungi | Fungi | |
| Plantae | Plantae | ||
| soit Protozoa (=Animalia) soit Algae (=Plantae) | Protoctista | Alveolata | |
| Stramenopiles | |||
| etc... | |||
| Sporozoa | |||
| Mycetozoa | |||
| Euglenozoa | |||
| etc... | |||
| Archezoa | |||
| Plantae (bactéries ou algues bleues-vertes) | Monera | Eubacteria | (règnes non précisés) |
| Archaea | Euryarchaeota
Korarchaeota Crenarchaeota |
||
La diversité de la vie apparaît donc bien plus complexe que ce que l'on imaginait, les organismes qui nous sont familiers, plantes et animaux, ne représentent qu'une toute petite partie des formes de vie.
Le diagramme suivant illustre les relations entre les trois domaines et les divers embranchements au sein de chaque domaine.
Domain Archaea « Achaeobacteria » |
Domain Eubacteria |
Domain Eukarya |
Nous nous conformons dans la mesure du possible à un modèle cladistique sans rangs fixes. Néanmoins, les cladogrammes, avec leurs bifurcations continuelles, ne se prête pas à la mise en place d'une structure hiérarchique, indispensable au bon fonctionnement d'un site web. En conséquence, nous avons adopté un modèle à cinq règnes modifié, par souci de commodité. Nous utilisons en fait six catégories, à savoir :
Bacteria: cette section couvre à la fois les Eubacteria et les Archaea.
Eukarya: cette section ne traite quasiment que d'organismes unicellulaires, les « Protista » ou « Protoctista ». Pour des raisons historiques et phylogénetiques, les plantes basales et les algues rouges (Rhodophyta) sont aussi dans ce groupe.
Plantes : il pourrait être plus exact d'intituler cette section Chlorobionta. Comme nous l'avons dit, le clade Plantae est légèrement plus inclusif, et s'étend aussi aux Rhodophyta et à certaines « algues vertes », traités dans la section Eukarya.
Fungi : au vu de notre définition des Fungi, cette section se devrait sans doute d'inclure les Microsporidia. Ce n'est pas le cas. En dehors des Microsporidia, cette section couvre l'ensemble des Fungi.
Invertébrés : c'est là que nous nous attaquons à l'ensemble des métazoaires, chordés exceptés.
Vertébrés : enfin, la plus vaste section de Palaeos couvre les chordés, c'est-à-dire principalement les Vertebrata
Cinq règnes du vivant - Wikipédia, l'encyclopédie libre et gratuite:
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Le classification en 5 règnes (Whittaker, 1969)
L'évolution biologique - des procaryotes aux eucaryotes
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texte anglais © M. Alan Kazlev 1998-2002
dernière révision ATW050724
page mis en place Kheper MAK980623
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traduction Félix Landry 050818
checked ATW050724